1967 yılında Niğde’de doğdu. İlk, orta ve lise öğrenimini Ankara’da tamamladı. 1989 yılında Orta Doğu Teknik Üniversitesi (ODTÜ) Siyaset Bilimi ve Kamu Yönetimi Bölümü’nden mezun oldu. 1996 yılında Uluslararası İlişkiler (ODTÜ) alanında yüksek lisans, 2002 yılında ise Siyaset Bilimi (ODTÜ) alanında doktorasını tamamladı. Dr. Gündoğan’ın Amerikan Yüzyılı: Amerika Birleşik Devletleri’nin Yükselişi ve 11 Eylül 2001 (Liberte Yayınları, 2008) başlıklı bir kitabı ile siyaset bilimi ile uluslararası siyaset alanlarında çeşitli makale ve tercüme eserleri bulunmaktadır